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Visuel solution bio informatique
Bio informatique
Comment optimiser l'analyse des donn³es g³nomiques et ³laborer votre propre strat³gie de recherche scientifique ?


CEFI, Gene-IT et Sun

Trois partenaires technologiques de référence ont associé leur savoir-faire pour vous proposer une solution sur mesure innovante, puissante et fiable, qui va révolutionner la recherche en bio informatique en optimisant vos performances. L’expertise de l’intégration hétérogène des équipes de CEFI et leur maîtrise technologique vous permettent, avec succès, d’intégrer à votre architecture technique le logiciel de bio informatique Biofacet de Gene-IT. Avec cette solution destinée à l’accélération de la recherche de similarités et de regroupement de séquences, vous multipliez les performances obtenues et mettez en place les nouvelles stratégies de recherche qui vous permettront d’optimiser le champ de vos découvertes. L’environnement ouvert, robuste et évolutif de la plate-forme Sun Solaris vous assure un niveau de performances accru. Grâce à la technologie Sun, partenaire historique de Gene-IT, vous bénéficiez d’une excellente disponibilité et d’une haute fiabilité de l’ensemble de vos données, garantes d’une meilleure exploitation de la solution.

Rapidit³ de calcul

Avec Biofacet, logiciel de bio informatique, vous accélérez le temps de recherche de similarités et de regroupement de séquences de protéines ou d’ADN. Cette nouvelle technologie combinant l’algorithme BLAST avec la rapidité et la précision des algorithmes propriétaires de «string matching» de Gene-IT, vous obtenez en seulement quelques jours des informations qui nécessitent habituellement plusieurs mois de calcul. “Biofacet nous a permis d’annoter entièrement le génome humain en moins de quatre jours, en positionnant 3,8 millions d’EST et presque un million de protéines”

Jean-Jacques Codani,Président et CEO de Gene-IT.

Solution unique

Biofacet est basé sur la même architecture logicielle que Lassap, le produit phare et éprouvé de Gene-IT, déjà largement utilisé dans la bio-industrie pour la mise en place de nouvelles stratégies de recherche. Ses multiples fonctionnalités, indispensables à l’annotation automatique du génome par comparaison de séquences, répondent à de nombreux besoins :

  • assemblage et annotation de génomes entiers ;
  • analyse de grandes bases de données publiques ou privées ;
  • comparaison de génomes de différentes espèces ;
  • regroupement d’EST ;
  • création de bases de données de séquences non redondantes.

Grâce à Biofacet, ces calculs intensifs à grande échelle vont enfin pouvoir être réalisés en quelques jours au lieu de plusieurs mois.

Ils font confiance à Gene-IT
AFM/CNRS, BioMérieux, EBI (Royaume Uni), Derwent Ltd (Royaume Uni), Genescope, InfoBiogen, NV Organon (Hollande), Institut Pasteur, RhoBio Aventis Cropscience/Biogemma, Servier Labs, Dupont de Nemours (Etats-Unis).

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Accroître les performances, un enjeu stratégique pour la bio-industrie.
La compétitivité scientifique et commerciale de la bio-industrie repose principalement sur la capacité de traitement rapide de la production à grande échelle de données génomiques. Pour relever ce défi, les responsables des recherches ont besoin d’une technologie qui répond très rapidement aux exigences d’analyses complexes et met fin aux méthodes de calculs lourds et hétérogènes. En utilisant une solution logicielle dotée de puissantes capacités d’exploitation, les biologistes vont enfin pouvoir ouvrir leurs perspectives de recherche.

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